据12月26日中国青年报报道 2006年1月17日，一个类似美国“水门”事件中“深喉”的人物，在清华大学水木清华BBS上，公开指责上海交通大学微电子学院院长陈进教授发明的“汉芯一号”造假。一些嗅觉敏锐的媒体很快介入，进行了艰难的追索和求证。在举报人和媒体的共同努力下，一个个事实渐次浮出水面。一个月后的2月18日，该事件的调查组得出结论：“汉芯一号”造假基本属实。值得注意的是，即使骗取了如此数额的科研经费，上海交大仍未提及事件责任人有没有受到法律追究。时值年末，中国青年报记者向国家有关部委询问的结果是，确实没有相关责任人受到任何法律上的追究。

中国人民大学教授顾海兵表示，他不满意汉芯事件的处理结果，“评审专家应该负什么责任，相关部门要负什么责任，也没有结果。目前处理力度很不到位”。

清华大学中国科技政策研究中心主任薛澜教授也表示，汉芯事件反映出中国科技体制中的弊病，这种弊病要求有关部门去真正反思和挖掘弊病产生的原因，并从根本上解决这个问题。

整个2006年，先后有一批学术失范行为被揭发、处分。2006年6月，科技部负责人公开表示，将认真吸取“汉芯”造假事件的教训，从多方面进一步完善监管制度，根治学术腐败。同年11月7日，科技部发布了《国家科技计划实施中科研不端行为处理办法(试行)》，表示对于科研不端行为，要实行从警告、批评直至终止项目、收缴经费、在一定时间内不接受有关人员的科研项目申请的处罚措施。但顾海兵认为，这个处理办法的细节还不够细，操作上也不够具体，尤其是如何进行法律追究应该更突出。“诈骗了1000万元该如何处罚，诈骗了100万元又该如何处罚，刑法都有很详细的规定。处罚学术造假和诈骗也应该跟刑法关联起来。”