考虑成为Microsoft公司Windows x64 Edition操作系统早期使用者的企业多了一个推迟这么做的理由：它们可能会发现自己喜爱的反病毒软件无法在新台式机上运行。

尽管Microsoft公司声称大多数面向32位版本Windows的应用软件都兼容64位版本的Windows操作系统，但内核的修改意味着一定类型的软件需要针对64位平台重新编写。

Microsoft公司Windows客户端集团的资深产品经理布赖恩说，我们每次对内核作重大修改时，在内核模式下运行的任何软件都需要重新编写。对于x64 Editions版Windows而言，尤其需要重新编写的包括设备驱动软件和反病毒软件。他表示，除此之外，只有很少类型的软件“深深”地介入了操作系统内核。

因此，使用McAfee公司的Internet Security Suite或趋势公司的PC-cillin Internet Security将必须等到2006年之后，因为届时它们才会发布x64 Edition版产品。企业可以购买支持x64 Windows的AntiVirus Corporate Edition 10.0产品。Symantec 公司的代表没有表明它是否计划开发64位版面向小型企业和家庭用户的反病毒软件。

Eset公司的技术总监安迪承认，目前，64位版本的Windows中只发现了数量很少的缺陷，由于用户数量太少，它对黑客没有什么吸引力。但他指出，早期使用者希望使用反病毒软件。目前最大的困难在于许多大牌安全厂商都还没有推出64位Windows版本的解决方案。

据布赖恩称，这一难题只局限于数量相当小的台式机用户。Microsoft公司预计，在Windows Vista于2006年末问世前，64位Windows计算平台将只局限于企业市场上的超高端PC用户。他说，我们预计64位计算将成为主流技术，时间大约与Windows Vista发布相当。

Microsoft公司预计，一旦64位反病毒产品成为主流，用户将能够体验到与安全相关的性能体验。例如，加密的速度将更快。